巴东县位于亚热带季风区，温暖多雨，湿热多雾，四季分明。光、热、水分布垂直差异明显，形成各种不同的山地型小气候。海拔升高100米，气候平均下降0.62℃，无霜期减少5～7天。太阳辐射总量处于全国低值区，年平均88～99千米卡/平方厘米，日照总时数在1200～1650小时之间。气温立体分布，无霜期最长为311天，最短173天。年平均降雨量为1100～1900毫米，多集中4～9月。年风速偏低，平均风速1.5～3.4米/秒，多为偏东风和偏西南风，北风、西风频率低。